Entre los ordenamientos aplicables a la preservación, protección y aprovechamiento de los recursos naturales, se tienen:

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-Ley General del Equilibrio Ecológico y la Protección al Ambiente (LGEEPA)

-Ley General de Bienes Nacionales

-Ley Federal de Derechos

-Ley Federal de Procedimiento Administrativo

-Ley General de Vida Silvestre

-Ley General de Desarrollo Forestal Sustentable

-Ley de Bioseguridad de Organismos Genéticamente Modificados.

-Código Penal Federal

-Reglamento de la LGEEPA en materia de Impacto Ambiental

-Reglamento para el Uso y Aprovechamiento del Mar Territorial, Vías Navegables, Playas, Zona Federal Marítimo Terrestre y Terrenos Ganados al Mar.

-Reglamento de la LGEEPA en materia de Áreas Naturales Protegidas.

-Reglamento de la LGEEPA en Materia de Ordenamiento Ecológico.

-Reglamento de la Ley General de Desarrollo Forestal Sustentable.

-Reglamento de la Ley de Bioseguridad de Organismos Genéticamente Modificados.

-Normas Oficiales Mexicanas (NOM) en las distintas materias de recursos naturales.

-Decretos y programas de Manejo de las ANP.

La PROFEPA protege a los recursos naturales, evitando así malos manejos por parte de la biotecnología, ni experimentaciones que pongan en peligro al experimento y a los consumidores, de igual manera que se proteja al medio ambiente, tomando en cuenta las ramas de la agricultura, la bioquímica y obviamente la sociedad.

La PROFEPA realiza programas de inspección y vigilancia del aprovechamiento de nuestros recursos naturales, procurando su conservación y manejo sustentable.